どれを凸するべきですか？

まず、攻略に使うキャラを決めて、そのキャラをレベル100にすることから始めましょう。正直に言いますが、優先順位があべこべになっています。せっかく凸しても、プレイヤーとキャラの相性が合っていなければ全くの無意味ですし、凸の恩恵はレベル100で実感となることも事実です。目先の利益で虹ルーンを使って後悔しないとも限りませんので、凸は慎重に行いましょう。

以下、相性云々ガン無視で、単に凸の恩恵の大きさ＆SP回復量UPの観点でオススメを上げます。
・レイヴン
スキル2の追尾が便利で、雑魚処理で大活躍間違いなし。スキル回転率の観点で凸の恩恵を一番受けやすいです。SP回復量が3→4になると世界が変わります。操作して相性に問題がないのであれば、ためらわずに凸してもいいくらいだと思います。アーチャーそのものが敵の攻撃範囲外からの攻撃を得意とするので、SPも溜めやすいです。
ネム限定施設（全キャラのHPとSPがUPする建物）は完成させましたか？レイヴンを凸させる場合は、完成していれば１凸、未完成なら２凸でSPR4です。
・正月ミオ
2凸（ネム施設込みなら1凸）でSP回復量5です。さらに、リーダースキルのおかげでパーティ全員が死ににくくなります。その上、スキル２は敵に囲まれた時の緊急脱出用としても有用。今流行りのスキルブッパ勢とは違い、タゲを意識しながら戦えて楽しいです。
ただ、慣れるまでが大変なキャラなので、あまり使い込みもせずに文句を言う人が結構います。私は7島までこのキャラでクリアしましたが、スキル２使ったらボス部屋に意図せず突っ込んだこともありました・・・。

他に凸の恩恵が多そうなのはクローですが、残りの1凸を注いだところでスキル２を打てる回数は変わりませんので、余らせてもいいと思います。斧自体扱いが難しいので、後回しにしましょう（亀処理も拳で充分です）。双剣は武器を揃える条件が難しいので、攻略序盤での育成自体オススメしません。