白猫の回答詳細

ギガスで覇権となっていた弓トワ
麻雀牌を飛ばす攻撃の多段が凄まじい茶セツナ
チャージで連射でき通常に無敵時間満載の探偵フラン
派生攻撃でステルス(双剣ジュダ･ピアナ)派生攻撃中にスキルで追加効果持ち(イロメロ)
フォームチェンジ以外にもシュガーやケーシーの通常超ヒットキャラや通常強化にHP吸収が付いている茶ヨシュア(茶ネモも)
まだまだ強いフォームチェンジや通常攻撃強化を持っている子達はいっぱい居ますがきりがないのでここで止めます…

長々となりましたが結論から言うとキャラと武器によってまちまちです
例えば弓トワはオリジナルフォームを使う時は基本ギガス弓で通常主体で運用します
しかし､水属性特化で運用したい場合はエクストラフォームにして祝福弓を使います
エクストラフォームはチャージが継続されるので高火力の水属性攻撃を連発することが出来る為です

弓トワのように使い分けが出来るキャラも居ますが､基本的にフォームチェンジ･通常攻撃強化を持っていないキャラはエクストラフォームで運用で良いと思います
また､基本的にエクストラフォームの方が火力が高いです
特に拳はコンボチャージが継続するのとしないので相当火力が変わってくるので拳のフォームチェンジキャラは苦労することがままあります…
拳ルカはフォームチェンジでバリア2種を味方に付与出来ますが火力を求める(エクストラフォームにする)とバリア2種配布出来ず火力は上がるが自身の耐久は大幅ダウン…なんてことも
基本的にはエクストラですがオリジナルフォームでの運用も強いキャラは大抵解説が入っていると思うのでその都度攻略サイトを覗いたり自分で使ってみてどちらがいいか試してみる…というのも有りだと思います。