プレゼントボックスと素材庫はどう分ける？

質問者と同じような運用ですが、マナプラスとエーテルはある程度プレボに残しています。
これは、ガチャを引くときにボックスをフルにするための穴埋め用ですね。

また、エーテル分類になりますが、使わないと素材庫で日ごろ邪魔になる魔道杯のSS杯、L杯はプレボに残しています。
プレボのページ数よりも、使わないのに素材庫で一枠使っている奴の方が明らかに邪魔ですので、その辺は気を使っています。
同じような理由で、イベント内で重複取得できる特定精霊の進化素材などは今度時間があるときに整理したいと思いますが、捨てれましたっけ？（スザククロの進化素材骨とか）

私のプレボは1000超えてますが、必要な物は探せます。
ソート機能もありますし、ページめくるのが苦になりません。
素材庫も保管庫もなかった頃からこうなので、やり方を変える必要を感じません。

そもそも私は使える状態の物は際限なく使いまくるので、使えないな状態でクリスタルを始め、進化素材や強化素材を貯めておきたいのです。
使いまくるほど良いカードを沢山引いている訳ではないですが、私の性分です。

逆に聞きたいですが、普段使う素材庫のソートをいちいち弄る方が面倒じゃないですか？
結晶探す方がプレボ漁るより面倒です。
私は素材庫にごちゃごちゃ物がある方がやだなぁと思います。

やり方なんて十人十色、やり易い方法をそれぞれ使えば良いと思いますがね。

確認してみたらプレボ226頁ありました。

えすさんの回答にあるように、マナやエーテルはガチャ引く前にボックス埋めるために使うこともあります。
ガチャ引くときは基本的にメイトガチャで埋めます。埋めるのも何回もやるのは面倒なのでガチャ抑制にもなってますw
ボックスは常に830～870くらいにしています。でも雑魚敵が50～100程度でイベント精霊のLvアップ端数調整に使います。

ガチャのA精霊は大量にプレボにありますが、進化で必要になるかもしれないので貯めてあります。
でも必要になる事はそうそう無いので特に困りません。マナにしたところでマナもいっぱい有るので・・・
SS以上の被り精霊は保管庫です。2体目が必要になってもすぐ出せます。

素材庫のマナは6000位でいっぱい減ると「今月は精霊結構増えたんだな」などと思えます。減ったら適当に補充します。
イベント系の強化素材等は全部引き出してますが、数が増えて邪魔だとは思うものの、よく使う物の場所は覚えてしまうので困りはしないです。

プレボには素材以外のものが殆どです。マナ、エーテルは残してますが、個人的には素材はプレボに貯める意味はあまり無いかなと思います。

限定精霊以外は結構放置です。

思い出した時に（主に不足した時）魔導書と進化素材とエーテルと結晶は一気に素材庫に移動。
他はプレボですね。
ゴールドとかマナは不足したら引き出す。
精霊にはソート機能欲しいかなぁ。今回の神龍復刻みたいな時に、探しやすいので。まぁ、なくてもいいけど爆死の過去を振り返る事にもなるので、チョットへこむんですよね。
私はガチャる時はメイトガチャで埋めています。cとかの素材集めにもなりますし。
基本、整理整頓苦手なのでフィルター機能がつく前は2ヶ月事位にエクセル管理っぽい事してました（←えぇ、この言い方でわかるように適当に取り出したりするから結局わからなくなってた）
フィルター機能ついて、埋蔵クリスタルが4個出てきた時には超嬉しかった！

有用なプレボ運用ではなく、単純にめんどくさがりってことですね…orz

う〜ん、恐らく私の勘違いだと思いますが...。
お友達はガチャ精霊をプレボに保管してるのではないでしょうか？

ご存知のように手持ち(保管庫は除く)に空きが無い状態でクリスタルガチャをするとゲットした精霊はプレボに保管されます。私はこれで不要なガチャ精霊を塩漬けして必要な時に復活させることでボックスの圧迫を避けています。
※typhoonさんの記述に「ボックス圧迫の重複精霊」とあるので、ここまで読んでバカにするなとお怒りかもしれませんm(_ _)m。

私も素材庫に入るものなら引き出しても何の不具合もないのですぐに出しますね。今回の魔道杯報酬も引き出し済みです。あと、プレボのソート機能は上記塩漬け組の引き出し時のみすごく欲しいです。

以上、勘違い確率の高い回答でした。

自分はプレボに残すのは経験値本とゴールデンポットと魔道杯の報酬ゴールドはほぼ残し、あとはイベント報酬精霊の初回5回10回15回のクリア報酬ですかね。
経験値は魔道杯開催中に使いますが何やかんやに250ページ分は残してます。
ゴールド系は結晶化や進化にゴールドが足りない時に必要分だけ取ります。これも250ページ分はあります。
報酬精霊は必要ないと思い売却したり強化素材の餌にした際の保険ですかね。レイド初期の牙や鎖もまだ入れてます。【使う事は無いかと思います】
昔は強化素材や進化素材もカード枠を圧迫する要因でしたのでプレボに入れてましたが今は素材庫という四次元ポケットがあるので大分便利です。
それも踏まえ魔力の消費法則ですが、自分の場合は進化素材はとりあえず全て50枚以上はストックする為進化素材をまわり次にゴールデンポットをまわりゴールドも300,000,000-以上まではストックします。【これがなかなか到達出来ず新イベントスタートになる】
魔力がなくなるとレイドで強化素材狩りをしてます。
魔力消費とプレボから脱線しましたが最後のレイドは強化素材、エーテルはプレボに入ります。逆にゴールデンポットでカード枠を圧迫したら進化素材もプレボに入ります。
要はプレボは別の四次元ポケットと思えばいいかと思います。ソートも付いてるし全然使えますから利用手段も臨機応変ですよ。

プレボ1300ページ超えました(笑)
といっても、私の場合は原則、
・素材庫
　魔導書　マナ　エーテルなど
・プレボ
　クリスタルガチャを引いて、引き出したもの以外（重複精霊）　ゴールド　経験値　メイト　イベント専用進化素材
となっているので、typhoonさんとおおむね同じです。

ソート機能は不要だと思っています。サーチできるならともかく、同じ精霊が50枚とか普通に並ぶだけでは、まったく意味をなさないので（笑）
ちなみにプレボの内容をエクセルで管理しているので、欲しいもの（過去イベの周回報酬精霊・ブレーダー系のあまり・限定精霊のかぶりなど）は一発でどこにあるかわかります。

というわけで、これといって有用な使い方は特になく、現状の運用が一番いいんじゃないかなぁと思います。

僕のプレゼントボックスは常にゼロ。
中途半端な場所にものが入ってるなんて許せない。
すべて素材庫、保管庫、ボックスに入れます。
いらないものを残しておくのが許せないたちなので雑魚敵や使えない精霊なども全部断捨離。
必要ないと判断したものは即売却です。

使い分けてます。プレボ1200ページ、保管庫2は未解放です。

プレボには、ガチャのハズレを全て入れてます。素材は約50枚ずつを素材庫に移して、あとはプレボです。

ガチャを引くときは、素材（強化や覚醒）を全てボックスに引き出してから回します。

プレボの中でも精霊だけは探すのが大変（400ページ超え）なので、イベント精霊などはこまめに取り出します。一方で魔道杯精霊は何体か残します。

後からイベント精霊が必要になったときは、魔道杯の日付とイベントガチャの名前から、だいたいの日付が分かるので、それを頼りに昔のイベント精霊を探したりします。

メリットは、ボックスを有効活用できることでしょうか。

特に使い分けをしているつもりは無いですが、私は素材庫実装当初にプレボの素材全て突っ込んで以来、プレボからエーテル以外補充したことがありません。

大抵魔力が溢れているので、素材庫の在庫状況見て、魔力の使い道として素材クエストで仕入れに行っています。今は狙った進化素材が簡単に手に入るので、プレボから引っ張る必要もなく、どんどんページ数が増えて1000ページはゆうに超えていっています。

溢れていておろす必要がないゴールドだけで400p超えてます笑

使い分けは特にしていません。
ソートができたから降ろす必要のないものは降ろしてないというほうが自分の思考回路に近いかも。

ボックスには経験値本しか基本ないです。
ゴールドは所持金がカンストしたら、プレボに残してます。
基本的に素材庫は所持数ソートで
すべて、強化素材、結晶、しか使わないので一枚だけの強化素材しかなくとも大して邪魔じゃない&プレボだとイラスト拡大できないので。
結晶は時々レア順にします。(大魔術結晶とか行方不明になるため)