魔道杯絶級　ターン数について

仕様かバグかは運営に問い合わせてみないとわかりません。

おそらくですが３Tにムニキスで左右が倒れた後に残滅で中が倒れたのであればムニキスの効果が発動した後、１体でも敵が残ってればターン数が加算される仕組みになっていると思われます。

発生条件がほぼ特定できたので、新しい回答にさせていただきました。
ご指摘の、ターンがひとつ余計にカウントされるのは、

ムニキスの発動ターンで、残滅効果によりクリアしたとき

です。
確認できたのは、２ターンムニキスではなく、３ターンムニキス（アーマードメア）ですが、れおさんのケースと同様に、

中央ミリ残り→ムニキスで左右消滅→残滅効果で中央が落ちてクリア

の時に、１面１Ｔ＋２面３問回答＝４Ｔのはずが、リザルトで５Ｔになっています。
あおさんがご指摘されたカウント動作の可能性が高いのですが、ムニキスのターンで中央が残り、次のターンでクリアしても５Ｔになっています。

念のため別の２Ｔムニキスで確認したところ、ムニキス発動ターン（３Ｔ）で中央が残り、次ターン（４Ｔ）の攻撃と残滅効果で中央が落ちたときはリザルトが４Ｔになっていました。
これから考えると、残滅効果が新ターンになるのではなく、ムニキスの発動時点でターンが終了したとみなされている可能性が高いです。

ここからは想像ですが、
現在の効果発動順位は

攻撃→反撃→ムニキス→残滅効果

ですが、
ムニキスが導入されたとき

攻撃→反撃→斬撃効果→ムニキス

を想定していて、ムニキス発動後にターンエンドを設定しているのではないでしょうか。

長くなりましたが、この症状はサポートに連絡していい内容だと思います。

参考になるかはわかりませんが、１Ｔ目でクラヴィルの残滅を使っていた時、残滅直撃（ミリ残り）→誤答→残滅効果追い打ちで、カウントは１Ｔでした。
このことから、ターンのカウントは、ＳＳ使用から残滅効果までが１ターンと考えられます。
ご指摘のパターンでは３Tは残滅で終わっているので、ターン内にクリアしたと見ていいと思います。
二通りのパターンを確認されているようなので、運営に連絡されたらいかがでしょうか。
このケースでは修正でプレイヤーが不利になることはないと思います。
ただ、魔道杯開催中なので、不公平を避けるため、魔道杯が終わってからの修正対応になると思います。