どちらのアカウントをメインにするべきか

自分としては、ツキミ垢を推します。

ノア垢とツキミ垢の、それぞれの島掘り性能を比較しました。
ノア垢も、イサミなどもいるので、それなりの速度では進められるとは思うのですが、
ツキミの高機動＆操作ビームは、やはり圧倒的な速度です。

今後のゲーム環境はどうなるかはわかりません。
質問者様が気にされてるように、ツキミメタの環境が来るかもしれません。
ボス構成により、ノア推しの環境になるかもしれません。
しかし、ツキミ・ノアいずれどちらのキャラも超えるインフレは必ずやってきます。

なので、自分は環境には左右されない島掘り性能、という面でツキミを推させていただきます。
質問者様の参考になれば、幸いです。

ノアの方で進めてみて、まだでる可能性のある茶熊ツキミなどを
狙ってみてはどうでしょうか？
自分も最近始めたばかりでなんとも言えませんが・・・

自分ならば島掘りの進み具合にもよりますが、
ノアの方でツキミもう少し狙います。
今の所ツキミでほとんどやっていけますが、
そのほとんどから漏れる部分をノアで押しきれる可能性が高いです。
両立させられたら単体ずつ所持するより何倍も価値があります。
ガレアは・・・ツキミ武器も確保して余力があれば・・・。
もう茶熊は回さないよ、と言うことであれば
ノア超えが来るのを願いつつ（いずれかは来ると思われる）ツキミ垢ですね。