エニグマ2エクストラ5―3ラスボス

とりあえず、どのようなデッキでプレイしているのか公開できませんか？ また、一般にエクストラはハードと同じデッキでクリア可能なはずなので、ハードはどうクリアしたのかも開示していただけると話がスムーズになると思います。

このクエストの詳細を憶えていないので攻略ページの記述に頼って回答しますが、水光闇吸収1000%があるので、水・光・闇属性の精霊が入っていて攻撃参加している(攻撃参加しないというのはたとえばボス戦までに落ちているとか精霊強化を発動していて行動しないとか)のであれば、もりもり回復してトータルゼロダメージということはあると思います。こうであれば、水光闇属性を持つ精霊をデッキに入れないもしくは行動させない、というのが怒らせるための解になり得ます。ASに全体攻撃がないのであれば、ターゲット操作で水光闇属性の攻撃をボスから外すという方法もあります。
怒らせさえすればいいのであれば、クイズパネルを踏むより前に攻撃SSでダメージを与える、という方法もあるでしょう。この場合、攻撃属性に水・光・闇が入っていないことが必要です。
また、効果解除・効果解除大魔術に属性吸収解除の働きを持つSSが存在していますので、これを用いれば吸収の問題はなくなります。属性吸収は20ターン継続なので、現実的にやるかはともかく、20ターン待つという手もなくはありません。

吸収より回復が問題とか？
1tで12万以上のダメージを与えないと怒りません。
2tで12万与えても回復されるのでノーカンです。

やり方としては攻撃SSで削る。
割合攻撃SSなら100%怒ります。
または、遅延をかけて殴る手もありますが、
怒り後は反射を張られるうえに回復も行うのでお勧めはしません。