何故この子に？

大賢者だからでは。

ノインは黒猫の魔法使いの魔法の仕組みを一目見て看破していたので、心眼が合うんじゃない？って感じで付けたんだと思いますよ。
他の精霊でも言えることですが、スキルと潜在の組み合わせよりは、ストーリーに沿った性能を持たせる事が多いです。
また、ただでさえ強い激化に心眼・破まで付けるとバランス悪くなる、なんて事も考慮に入れているかもしれませんね。

にへにへな魔法が降りてくるからじゃないかな～？にへっ

時代に噛み合ってないって意味ならば、アデレードとかの力の代償じゃないかな～？にへにへ～

潜在能力が邪魔で使いにくい、という意味なら真っ先に思いつくのは異国情緒かな。
あとは生贄向きの性能なのに九死一生があるやつとか。

キャラ愛は少なめなのでキャラ的なものは全然思いつかないです。

ノインの「心眼・破」は他に連れて行くメンバーが「心眼・破」無しかつ特効大魔術等スキル反射に引っ掛かる場合は使い道がありますね。

噛み合ってない潜在はとしてはUSGエリスのような状態異常無効精霊にｓｐスキル封印無効潜在があることですね。

例としては
敵に全体ｓｐスキル封印を使われる→異常無効スキル持ち精霊が潜在で自身のみｓｐスキル封印を無効化する→異常無効を使うもすでに他のメンバーはｓｐスキル封印状態のためスキルが使えず意味がない…といったことになってしまうためです。

ＡＳとＳＳの不適合ほどには、潜在の不適合は気になってないです。
心眼は特に気にしてませんので、ときどき「あれれぇ　誰が心眼持ちなの？　助っ人か？」みたいな感じです。
まあでも、一人で完結させるのではなく、組み合わせを重視しているんじゃないでしょうかね。「見破りたければ、大賢者を連れていけ」ってことでね。

ただ、レメモなどの状態異常無効化持ちには「スキルディスチャージ無効」や「ＳＳ封印無効」、また起死回生持ちには「心眼」が欲しいかなぁ。敵のＨＰが今何％なのかわからないときがありますので。
組み合わせかやっぱり。