黒猫のウィズの回答詳細

とりあえず、現状「闇のみに対する特攻」は存在しません。ミコト3(以下ミコト)は「火・闇特攻」です。

結論から申し上げますと、精霊には「適材適所」というものがあり比較的高速周回が可能なウラガーン周回においてはSSの周期が長いミコトはミスマッチと言えます。ミコト以外のデッキの構成によってはあまり役に立たなくて当然です。

SSの周期とAS以外で大きく違う点と挙げますと、それは「SSの性質」です。

USGリルムは単体をピンポイントで打ち抜くというものです。SSの始動もそこまで遅くないことから、「ボス戦までが比較的短いクエスト」や「ボス本体だけが高HP」という場合にうってつけです。

それに対してミコトは「(発動は遅いが)SS1でも反射無視」「対象が全体」といったリルムには無い魅力を持っています。
そんなミコトが役に立ちやすいのは、ノクトニアポリスやアユタラ15-4のといった「最終戦到達までに時間がかかる」「最終戦に高HPの敵が複数出てくる」といったクエストです。

彼女らの性能に上も下もありませんので、クエストによって上手く使い分けてあげてください。

それから種族の統一性を気にされているようですが、現環境では種族を統一する恩恵はほとんど無く、それに拘るのは正直時代遅れと言えます。
実際、mukkさんが挙げた画像のデッキで術師UPの覚醒を持っているのはGPエッタの攻撃200のみです。リルムを抜いてミコトに変えたとしても、そのミコトはアリエッタの術師UPを受けられない代わりにピピアの「光属性で更にHP・攻撃200UP」の恩恵を受けることができるため決して悪くないと言えます。