イベントミッションクリスタル

最終進化後に本から解放した際に、ミッションがあれば達成できます。
しかし、◯◯を最終進化というミッションはイベント開催時のみ行われて、本からの解放時には消えている場合があります。イベントによりけりなので、あるイベントもないイベントもあります。なので、基本的にはイベント開催時に進化ミッションは済ませておくことをオススメします。

リセットされない限りはイベント開催時でなくても大丈夫です

例えばロスエデ1のサドベリクは一度リセットされたので復刻後に再度ボスを作らないといけませんでしたし、八百万1のナゴミ関連のミッションもリセットされたので再度ミッションが出たりしました

まあイベント解放はわざわざしなくても復刻まで待てば良いと思いますよ

イベントクエストのミッションのうち、そのイベント独自の報酬に関わらないものは、魔道士の家…じゃあなかった、君の本からの解放では出現しないと思われます。
運営による復刻の際にも出ないのかな?
ルールがユーザーに提示されていないのではっきりとはわかりませんが。

※独自の報酬とは、精霊、一点ものの潜在結晶、隠しクエストの解放、等(?)

で、解放や復刻で出現するものについては、終了後にボスを完成させていると、解放もしくは復刻時にクリア済で受け取れるようになります。
私自身、これで受け取ったことがあります。
ですが、復刻時にミッションに関して運営にミスがあったことが複数回ありますので、出なかったら運が悪いと思うしかないのではないでしょうか ^^;

イベントを解放するとそれに伴ってミッションにでるボス進化を解放時間が終了してミッションも消えてる状態で進化させても大丈夫？とゆうことでしょうか？

体験がないのでどうなのかわかりませんが、損をする可能性を無くすために解放時間が終了してからボスを進化させる祭にあらためてイベントを解放してミッションも表示させる方がよろしいかと思いますよ。