重複しているカードについて

現状で複数所持していてトップクラスで使えるのは、ヴィヴィだけですね。
手持ちの状況によっては、テスタメント3体や、カトレア数体もアタッカーとして役立つ事もあるでしょう。

Lまでまだ進化していない精霊は、今後の進化に期待して複数持っていてもいいかと思います。
限定精霊に比べると劣ってしまいますが、ルーシュやヴィヴィ、ハクアといった優秀な進化を遂げるものもいるので念のため。

上記だと
パイロン、マサキ、オーギュスト、リース、シド、クルス、フレデリカ
セレサ、ミナカ、セドリック、オデット、アンジュ、ファム、シーラ、メーベル、ラパパ、エーファ、ミカズチ

レジェンド化してない精霊がレジェンド化して、2枚運用してもよくなるように、変われば別ですが、現時点ではヴィヴィのみです。他は2枚運用するぐらいなら他の精霊を入れるべきです。

自分は基本的に2枚運用はしないコンセプトでやってますが(笑)

・セレサ、ラパパ、ファム、クルス、ヴィヴィ、リース（各２枚）
・マサキ、オーギュスト、テスタメント、カトレア（各２枚以上）
・その他（各１枚）

下記基準で選びました。
・良ステータス＋デッキに２枚運用できるＳＳ持ち精霊は残す
・属性とＡＳ、ＳＳによっては残す（例：戦士の回復）
・強アタッカーは複数枚残す（ただし、新精霊アタッカーを引いているなら不要）
・Ｌ化しても微妙だった精霊は合わせる

お持ちの精霊が結構充実していそうなので、現時点で絶対に複数運用出来ると言えるのはヴィヴィだけでしょうか。
あとはリースは今は出ないし貴重な火の戦士ヒーラーなので2枚あってもいいかと。
セレサはレジェンド化でどう化けるか分かりませんし、テスタメントは複数運用でより強くなるタイプですし…
ファム、メーベル、ラパパあたりもレジェンド化したらどう化けるか楽しみな精霊です。
プレボにあるのでしたら、どれも2枚は置いておいてもいいかもしれません。