黒猫のウィズの回答詳細

1.有償石、無償石みたいにクリスタルの種類を分けるってことですよね？
そんで有償石限定ガチャを作る、ということであれば、可能です。
現に有償石と無償石をわけて、有償でしか回せないガチャであったり、一日一回だけ少ない有償石でガチャを回せる、というような形式のゲームは存在します。
ただ。そういったゲームはそのゲームの特性上その形式で収益が上がる、と判断しているからそうしているに過ぎませんし、多くのゲームはウィズと同じように、有償無償の価値を区別しない形式をとっています。(他の方がおっしゃるように内訳を確認することは可能ですが)

で、前提のお話なのですが、ウィズは配布石がめちゃくちゃ少ないわけではない割に(平均してみれば)、石がそこまで高価ではなく、ガチャ確率も悪くはありませんし、基本的には別枠ガチャ(高レアリティの限定カードは全てイベント限定カードのガチャ)です。
簡単に言えば、ひとつのガチャに対して100連ちょっと回せば大抵はそれなりの収穫を得られますし、金額にしても2,3万円程度なので割と良心的な方です。
ましてや、ゲームの内容としても、課金が必須なゲームバランスではありません。

んで、視野をひろくしてみましょう。質問者様が望む形式にしたとして、
・ユーザーは増えるでしょうか？
・完全無課金のユーザーは続けるでしょうか？
・廃課金の人は嬉しいだけでしょうか？
・限定精霊の価値はどうなるでしょうか？
・どういった環境に変化していくでしょうか？
・このゲーム長持ちするでしょうか？
というようなことを、今一度考えてみましょう。ソシャゲは慈善事業ではなく、収益を上げる必要があるということもふまえて。

妥協か最善かはユーザーには分かりません。
が、いまの形式は妥当だとは思います。

2.公式のアナウンスとしては、大人の事情、ある場所からストップがかかった、という生放送での発言がありました。
ガチャ精霊もカウントされる図鑑だとコンプガチャ禁止に引っかかるおそれがある為、難しい、という見方が濃厚とされています。
仮に大丈夫だったとしてもグレーゾーンではあると思うので、そういったリスクは排除するってことなんかな、という個人的見解です。

3.ずっとこうです。
おっしゃりたいことはよく分かります。多くのソシャゲのランキングイベントでは、同様の印象です。
ただ、他の方もおっしゃるように、毎回総合狙ってるユーザーは、情報入手方法やある程度の目安も把握できているってのが実情です。
それに、仮にウィズで、公式で途中の上位ボーダー目安が分かったとしたら、普段調べずにやってる多くのユーザーも食い付いて、ボーダー爆上がりが容易に想像できます。みんな考えることは大体同じなので。にんじんを目の前にぶらさげられたお馬さん状態です。
ただでさえ長い間、月一開催に疑問の声が上がってるのに、そんなん起きたら「もうついていけん」ってことで引退者が急増しそうだなぁ、って...。

個人的見解ですが、今のウィズ、売り上げ上位常駐アプリの中では、ユーザーの不満を抑える対応という意味では大分良心的な方だと思います。

もちろん、ウィズ運営さんに不満も多々ありますし、ウィズに限らず「ソシャゲ」自体が理不尽なものです。なので、割り切って楽しむのが一番だと考えてます。