ギガキューブの武器スロット

まずスロット3は最も伸びがいい会心ダメ20にしましょう。期待値としては7〜8%ほどの強化です。
スロット2について
シェリルは攻撃値が
武器オートで50本人オートで200〜400
タウンがこれは個人差ありますが僕の場合は約170で計420〜620の強化になります。ここに変身時攻撃20を加えた場合の強化率は攻撃強化が最大時で計算すると
7.4÷7.2−1で約2.78%の強化
通常ダメ
武器オートで500本人オートで150で計650の強化。ここに通常25を加えた場合
7.75÷7.5-1で約3.3%の強化
なので通常25の方が強化率が高いです。一応変身直後は5.4÷5.2-1で約3.8%と通常25を上回りますがシェリルは変身状態を維持しやすいですし、ゆっても30秒で最大までいくので最大時で計算させてもらいました。（12秒で通常25と同じ強化率）
また、トランスバースト時は攻撃がさらに50上乗せされ、協力では通常ダメアップよりは攻撃アップのほうがもらいやすく、実戦での平均の強化率の差はさらに開いていくと思います。
稀だとは思いますが極度に打耐性をもつ相手に対して変身前で殴るという場合にも通常25なら活きます。
以上から質問への解答はスロット3は会心ダメ20、スロット2は通常25です。
ただしタウンの攻撃値が170%以上かそれより少し低いくらいであればいいですが大幅に低いのであれば変身時攻撃20のほうがいいです。そのへんは要計算です。

正直微々たる強化です。スロット3は会心ダメでいいと思いますがスロット2はチャージ短縮にしてアクセもチャージ短縮10にしてトランス限界までうちやすくするという手も…すみませんシェリル持ってないので使用感についてはなんとも言えません。

スロット3については会心ダメージの方が期待値高いようです
1.2については通常ダメージ特化か攻撃UPで良いかと思われます