低燃費編成の艦がレベル上がらなくなった時はどうしていますか、それに関連してレベル上げの相談

フレッチャー艦隊自体の限凸は避けた方がいいですね。あれは無凸で使うための編成みたいなところがあるので。

他に育成したい艦があるのであれば、後々のことも考えればフレッチャー編成に拘らずレベル７０までの育成を済ませた方がいいと思います。もしくはフレッチャー編成のN艦1体と入れ替える。これなら燃費は抑えられます。

あとはある程度レベリングが進んでいるのであれば、いったん赤城・加賀掘りを中断して次の海域に進んでレベリングするのもありです。特に6章以降は紫パーツが落ちます。正直回れるならこっちを回る方がいいので、ある程度3－4周回して落ちなければ、6章以降に進んで艦隊を育てる方にシフトした方がいいです。育ってから改めてフレッチャーで掘りに戻ればいいので。イベ海域のハードも結構レベルと装備の強化は要求されます。こちらを優先した方が後々いいと思います。

燃費の悪い艦の育成は長時間委託を利用しています。長時間委託は総燃費20を超えれば3-4の効率を上回るとどっかで見たような気がします。あとはペア編成とかですね。こちらも燃費を抑えつつ手っ取り早く育成できます。なのである程度のレベルまでは委託と寮舎で、それ以降は海域でという風にしてます。

基本は残燃料と自艦隊の育成状況と相談でいいと思います。
イベント低難易度周回では低燃費艦隊は必要ですし、ストーリーや高難易度イベントでは高レベル艦が複数必要になってくるのも間違いありません。

以前に比べて、学校の実装等で経験値を取得する方法が増えており、そこまで拘らなくても、全体的な育成は容易になりましたので、気にせずそのまま周回でもいいといえばいいです。
が、やはりもったいないと感じるようでしたらガチ艦隊が2編成分の育成が終わるまでは、育成対象艦で周回しつつ、育成が不要になれば、低燃費艦に戻すのでも問題ないかと思います。