どれを優先的に育成したらいいですか

質問者様のレベルや手持ちなどがわからないので、始めたばかりだと仮定して述べさせていただきます。

水
①アルフ②フレイ③ミナカ④ダリオ⑤ヒルデ⑥カトレア
アルフとフレイはほぼ同時進行で育てましょう。特にフレイは終盤まで使えます。SS進化のために必要なS+世界樹の入手難度が高いので、とりあえずSを目標に育てましょう。
ミナカとダリオはS+世界樹が手に入るまではS(三段階目)までしか進化出来ないですが、それでもそこそこ強いです。SSに出来れば両方とも非常に強くなります。
ヒルデは手持ちが揃っている上級者用、カトレアはSSにならないと強くならない上にSSにしても終盤になるにつれて物足りなくなる性能なので後回しでいいでしょう。

雷
①トウマ②セシーリア③ヘルミーナ④セドリック⑤ルミィ　例外：ラエド
トウマはSまでは微妙な性能ですが、SSになると使いやすさ強さ共にトップクラスになるので最優先で育てましょう。セシーリアとヘルミーナも非常に優秀です。
セドリックとルミィは迷いましたが、セドリックの方が早い段階で高ステータスになり使いやすいので上にしました。ただし、SSまで育てた上での強さはルミィ＞セドリックなのでセドリックにエーテルを使うのはやめておきましょう。
ラエドはちょっと特殊な精霊で、進化素材クエスト攻略に特化しておりSS進化に必要なS+世界樹を入手するための特急券といった立ち位置です。他の精霊を早くSSまで育てたいのなら最優先で育てましょう。反面、他のクエストではあまり強くないので、そうでないなら後回しで構いません。