リレイ系のスキルについて

私も同じく魔道杯の時、問題選択してからSS発動→回答することが多いので、ヴィタのエンハのエフェクトがかかる前に攻撃してしまいギブンを倒せずに1T余計にかかってしまうことが周回する中で複数回ありました。

某サイトによると、チェイン犠牲強化の特徴として、エンハンスがかかるタイミングはチェインから飛んでくる光が精霊に当たり、それが消えるタイミングとなります。
「パネルを選んでからチェイン犠牲強化を使い、エフェクトの間に回答を連打して回答するとエンハンスが付与されないまま攻撃してしまうケースがあるので注意すべし。(2019年2月現在)」とのことでした。

また、こちらのサイトの「SS発動にかかる時間の検証」記事を参考にすると端末のスペック等にもよりますがチェイン犠牲強化は発動時に約2.7秒かかります。
パネル選択してから精霊をタップ→［OK］でSS発動するとその間にも回答時間は経過するので、選択肢で答えが一瞬で判別できる四択やスライド問題の場合には、エンハがかかり終わる前に回答してしまうっていう状況になりやすいかと思います。

普段のクエスト等で使う際は倍速モードがあるので、気になりませんが魔道杯で使う場合はちょっとつらい仕様ですよね。(パネル選択する前にSS使えばいいだけの話とはいえ)

少しでも参考になれば幸いです⋆*ೄ
※画像:光が消えていないのでエンハがかかり終わる前

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残念ながら、仕様か不具合かはシステム開発者しか知り得ないかと思います。
おっしゃる流れで想像すると、

リレイＳＳ発動→チェインへ光が飛ぶ→チェインが光る→チェインから精霊へ光が飛ぶ→精霊が光る→精霊に強化効果が付与される

という流れになっているのではないかと思います。
効果付与とエフェクトが同時に処理されることはなく、どちらかの順番で処理されることを考えれば、
リレイＳＳ発動→（精霊に強化効果が付与）→チェインへ光…
という処理より、先に書いた順番のほうがイメージと一致するのではないでしょうか。
普通は問題選択後にＳＳを発動させることは少なく、システム設計者もそこまで深く考えていないのではないかと思います。