お気に入りの登録がめちゃくちゃ

ここはツイッターほど厳しい文字制限は無いので、本気で答えを求めているなら、どういう状況でどうメチャクチャになったのかを書かないと答えは出ませんよ。
単に吐き出したいだけなら雑談板もあります。

この少ない情報から想像して真面目にお答えするなら、もしかして機種変更か何かで再インストールしたときにお気にいり登録が消えたというお話でしょうか？

黒猫は、サーバーと端末とそれぞれ手分けしてゲームのデータを管理しています。
カードでいえば、所有するカードの基本データ（何をどのレベルで持っているか）をサーバー側が管理し、お気にいりの登録情報は端末側が持っているものと思われます。

公開情報でないので想像の域を出ませんが、サーバーのデータ保管の負担を減らすため、ゲーム進行に影響のないお気に入りやデッキ名称は個々の端末保存で良いと判断したのではないでしょうか。
何れにしても、お気に入りの登録状況やデッキ名称はサーバーに保管されていないので、再インストールをすると初期状態に戻されるのではないかと思います。

メチャクチャの意味を取り違えているようであれば、申し訳ありません。

システムにご不満があれば、黒猫に意見要望の窓口がありますから、そちらへ要望をあげられるのが、ゲームシステム提供者に伝える手段だと思います。
このサイトは黒猫の公式サイトではありませんので、ここでいくら声をあげても意図は伝えにくいと思います。

あなたの質問の方がめちゃくちゃです。

何がめちゃくちゃなのかこの質問だけでは良く分かりません。
要望があるならここに書くよりご意見として運営に伝えてください。

ちょっと（かなり？）UIが分かりにくいのですが、Gamewithのお気に入り記事登録には２種類あるようです。

質問者さんがPCとアプリのどちらを利用されているのか分かりませんが、
ありそうなのは「②アプリ版お気に入りを登録」→「①PC版お気に入りのリストを参照」ですかね。（これだと、いくらお気に入りを登録してもリストに反映されないはず）
であれば、②のお気に入りの参照方法を確認してみてください。

画像の添付がなくてごめんなさい。分かりにくかったらコメントいただければと思います。。

アプリ版のお気に入り機能が使いにくいので改善していただけると嬉しいなぁと思うのですが、運営さんに意見を言う前に慣れてしまいました。

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①PCからお気に入り登録するもの
　・クラウドに保存され、全端末で同期されます。
　・アプリ版から見ると、左上のメニュー→お気に入りでアクセスできます。
　・PCやブラウザで開いた状態でお気に入りアイコンをクリックすると登録できます。

②アプリ版からお気に入り登録するもの
　・端末に保存されます。
　・アプリ版では、なんらかの記事にアクセスした状況で
　右上の紙が２枚重なったようなマークのアイコンからアクセスできます。
　・なんらかの記事にアクセスした状況で
　　しおりマークのアイコンでお気に入り登録ができます。
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